(b) रासायनिक अभिक्रिया में निषिध एण्डोन्यूक्लिएजेज वे द्वारा उत्पन्न DNA खण्डों को जेल इनलेक्ट्रोफोरेसिस के द्वारा विलगित किया जाता है। चूँकि DNA खण्ड ऋणात्मक आवेश वाले अणु होते हैं। एक माध्यम/मैट्रिक्स के द्वारा वैद्युत क्षेत्र के अंतर्गत इन्हें एनोड की तरफ आकर्षित करके इक्ट्ठा किया जाता है। DNA खण्ड अपने आकार के हिसाब से मैट्रिक्स द्वारा प्रदत्त छिद्र से होकर अलग किए जाते हैं।