(b) जार्ज बेन्थम तथा जोसेफ डाल्टन हुकर (1862-83)ने वर्गीकरण की प्राकृतिक पद्धति का वर्णन किया। इस वर्गीकरण में जीवों के सभी मुख्य लक्षणों जो इसके प्राकृतिक संबंधों की जानकारी देता है उस पर ध्यान दिया गया है। जो एक समूह से अधिकतम समानता तथा दूसरे समूह से भिन्नता को जानने में सहायता करता है। उदाहरण के लिए स्तनधारियों में स्तन ग्रंथि, बच्चों को जन्म देने की क्षमता तथा चार कक्ष वाले हुदय होते हैं। बेन्थम तथा हुकर ने वर्गीकरण की प्राकृतिक पद्धति अपनी किताब "जेनेरा प्लानटेरम" में दी थी।