एक जीन कोश को जनसंख्या में मौजूद प्रत्येक व्यक्ति के विभिन्न जीनों के संग्रह या सेट के रूप में संदर्भित किया जाता है। जीन व्यक्तियों में शामिल होते हैं जो जनसंख्या के रोगाणु कोशिकाओं के माध्यम से एक से अगली पीढ़ी को विरासत में मिलते हैं। इसलिए इसे युग्मक पूल भी माना जाता है। उदाहरण के लिए, पृथ्वी पर प्रत्येक मनुष्य एक-दूसरे के साथ अन्तः प्रजनन करने में सक्षम है इसलिए मानव जीन कोश लगभग 19,000-20,000 मानव जीन के प्रत्येक एलील से बना है।