भौगोलिक पृथक्करण स्वपरागित स्पीशीज़ के पौधें के जाति-उद्भव का हो सकता है क्योंकि भौतिक लक्षण भौगोलिक पृथक्करण द्वारा प्रभावित होते हैं और इनमें विभिन्नता जाति उद्र्भव का एक अन्य कारण हो सकता है परन्तु मुख्य कारण डी.एन.ए. प्रतिकृति के दौरान उनमें परिवर्तन आना होता है। स्वपरागित स्पीशीज में नई पीढ़ियों में नए बदलाव या विभिन्नताएँ उत्पन्न होने की उम्मीद बहुत कम होती है।