(b) पोलीपेप्टाइड्स के अतिरिक्त, संयुग्मी प्रोटीनों में सहायक वर्ग, धातुएं व आयन भी होते हैं। न्यूक्लियो प्रोटीनों में अतिरिक्त वर्ग, धातुएं व आयन होते हैं। न्यूक्लियो प्रोटीन्स, न्यूक्लिक अम्लों से जुड़ी प्रोटीन होती हैं। लिपोप्रोटीन्स, लिपिड्स से जुड़ी प्रोटीनें होती हैं। क्रोमो प्रोटीन्स, वर्णकों से जुड़ी प्रोटीन्स होती हैं।