भारतीय धर्मनिरपेक्षता और अमेरिकी धर्मनिरपेक्षता के बीच प्रमुख अन्तर यह है कि संयुक्त राज्य अमेरिका में राज्य और धर्म, दोनों एक-दूसरे के मामलों में किसी तरह का दखल नहीं दे सकते; जबकि भारतीय धर्मनिरपेक्षता में राज्य को धार्मिक मामलों में हस्तक्षेप करने की छूट दी गई है। उदाहरण के लिए, भारतीय संविधान ने छुआछूत को खत्म करने के लिए हिन्दू धार्मिक क्रियाकलापों में हस्तक्षेप किया है।