पाकिस्तान की जलवायु मौनसूनी एवं उष्ण मरुस्थलीय है। एक तरह से कह सकते हैं कि यहाँ की जलवायु विषम है। गर्मी में बेहद गर्म और जाड़े में बेहद सर्दी । एशिया का सबसे गर्म स्थान सिंध का जकोंबाबाद यहीं स्थित है। यहाँ जून में 55°C तापमान मिलता है। यहाँ वर्षा 10 सेंटीमीटर से भी कम होती है ।
बंगाल की खाड़ी से चलनेवाली आई मौनसूनी पवन यहाँ पहुँचते वाष्पशून्य हो जाती है और अरब अरब सागर से आनेवाला मॉनसून यहाँ पहुँच ही नहीं पाता । अत: वर्षा का अभाव है। हाँ जाड़े में भूमध्यसागर से आनेवाली चक्रवात कुछ वर्षा कर पाती हैं। यहाँ वर्षा का वितरण इस प्रकार है-(i) उत्तर के पर्वतपदीय क्षेत्रों में 75 से 80 सेंटीमीटर (ii) पूर्वी मैदान में 35 से 50 सेंटीमीटर और (iii) पश्चिमी क्षेत्र में 10 से 25 सेंटीमीटर । जनवरी में तापमान 10°C के आसपास रहता है । लाहौर में 11.5°C तथा पेशावर में 8.5°C रहता है । साधारणत: पाकिस्तान में जाड़े के मौसम में औसत तापमान 7°C से कम, उत्तर पर्वतीय भागों में बर्फ जम जाती है और गर्मी में औसत तापमान 45°C तक पहुँच जाता है।